Так не получается.
Дело в том, что данные действия приводят к изменению способа авторизации только самого MS Project Server. При этом авторизация IIS (проверка безопасности для Web узла, на котором установлен ProjectServer) остается.
То есть, перед загрузкой страницы Web Access появляется окно авторизации WinServer, если пользователь Win не зарегистрирован на Win2000 Server. Если его зарегестрировать или ввести логин имеющегося, то далее загружается страница доступа MSP и т.д. Так вот мне бы хотелось отменить вот эту первую проверку безопасности Windows2000Server.