Читаем readme.htm в корне инсталл СД диска.
Раздел: Запуск мастера настройки SharePoint ([])
Читаем
-------------
...
запустить [] с экрана программы настройки Microsoft Office Project Server 2003 с помощью ссылки "Мастер настройки Windows SharePoint Services"
...
---------------
те запускаем setup проджекта и выбираем 4 пункт сверху.
Служба МС Вин СПС. и там колдуем.
Ку дальше - мне негде проверить, но помню не тяжело:-)