Ничего сложного, когда делаешь не первый раз:-)
Сразу обратите внимание на правильную настройку OLAP сервера (идет с SQL сервером, но нет в MSDE). Тк быстрее всего захочеться формировать отчеты за большой период времени. Запросы напрямую в базу проджект сервереа через PDS достаточно ресурсоемки (на 2хксеон2,8 порядка 2 минут при почти выделенном для проджект сервера сервере).
Также вам прийдется быстрее всего поднять шарепоинт для документооборота проектов. В нем (точнее опять же в SQL сервере) есть смысл настроить полнотекстовый поиск. Есть один момент - нет поддержки сематического поиска для русского языка, прийдется использовать софт сторонней разработки.
PWA (project web access) достаточно не удобен для отчетности. У В.Богданова есть более удобный RealTimeTracker. Но у нас возникли проблемы при внедрении на русскую серверную платформу, причем на английскую пилотную - без проблем.
Пришлось разработать аналог RTT без серверной части но только под 2003 проджект сервер.
За основу брался СДК прожекта. Отлаживались PDS скрипты и переписывался интерфейс.